毫无疑问,建议选择川大。川大和厦大都是好学校,是各自城市的招牌性大学,都是985副部级大学、“珠峰计划”大学。但若只看工科,明智的选择显然是去川大。川大是文理工医的综合类大学,厦大只是文理类大学(其中化学和财会类是厦大的优势学科)。2011年的大学工科排名,川大工科是全国第15名,厦大工科是50名开外(厦大的工科实力未必比得上同省的福州大学),差距还是很大的。川大是老川大、成都科大、华西医大三所全国重点大学合并而来的。厦大未合并。厦大相当于川大三校中的老川大,文理科优秀但基本没工科。然而,川大还合并了成都科学技术大学,工科较强,这是厦大所不具备的。成都科大当年是中科院三所直属全国重点大学之一(中科大、浙大、成都科大),后来又与浙大一起转归国家教委,成为全国10来所国家教委直属的重点工科大学之一。在与四川大学合并前,成都科大的国家重点学科、国家重点实验室、科研经费等各方面基本都是西南地区第1名,全国理工类大学前10名左右。合并前的成都科技大学的工科综合实力及各种重要指标,是西南地区最强的。所以现在的川大的工科往往能排全国第10多名。(而厦大基本上是纯文理类大学)。不过,川大工科的优势学科主要是化工、材料、水利、电力、高分子、轻工、生医工程、计算机、核工程等学科,而自动化学科相对比较一般(读自动化的话,西部地区推荐西安交大,华东地区推荐上交、东南、南理工等),但该学科也明显比厦大强(厦大的工科远逊于川大)。此外,也得结合你具体考什么专业了,因为自动化这个本科专业,并没有对应的“自动化”这个研究生一级学科或二级学科。所以,你的报考方向,也是选择学校的根据之一。如果你是考电力系统自动化,或者机械设计自动化,那么川大是相当不错的选择,尤其是川大的电力系统自动化,是老牌子了,全国前10名左右,就业基本都是去电力系统单位。川大的机械设计类也不错。不过如果你是考控制工程方面的学科(该学科与自动化本科专业可能最为对应),那么就不推荐川大了(当然更不推荐厦大),控制类学科西部推荐西交、重大、两电,东部推荐上交、东南、南理工等。你可以根据你要报考的方向再多了解和比较。回到楼主的问题,当然选川大。其实只要是工科比较(川大和厦大),川大基本上都完胜厦大无疑。